El 23 de junio de 1995. Lorenzo Baldisseri es acreditado nuncio del Vaticano en el Paraguay.

El 23 de junio de 1995, monseñor Lorenzo Baldisseri fue acreditado oficialmente como nuncio apostólico de la Santa Sede en el Paraguay.
Había sido nombrado para el cargo por el papa Juan Pablo II el 6 de abril de ese mismo año.
Su misión diplomática en el país se desarrolló en una etapa de importantes tensiones políticas e institucionales.
Durante su gestión, tuvo un papel relevante como mediador en la crisis entre el general Lino Oviedo y el presidente Juan Carlos Wasmosy.
Baldisseri ejerció sus funciones en Paraguay hasta el 19 de junio de 1999.
Tras concluir su misión, fue destinado como nuncio apostólico en la India y Nepal, y posteriormente en Brasil.
Años más tarde, en 2014, el papa Francisco lo proclamó cardenal.
Su paso por Paraguay quedó vinculado a una etapa delicada de la vida política nacional y al rol diplomático de la Santa Sede en momentos de crisis institucional.