El 9 de septiembre de 1937. Juan Bautista Ayala es nombrado comandante en jefe de las FF.AA.

El 9 de septiembre de 1937, el general de brigada Juan Bautista Ayala fue nombrado Comandante en Jefe de las Fuerzas Armadas de la Nación durante el gobierno del presidente Félix Paiva.

Ayala había alcanzado gran prestigio por su actuación en la Guerra del Chaco, donde desempeñó importantes funciones de mando y participó en operaciones decisivas del Ejército Paraguayo.

Entre sus actuaciones militares se destacó la conducción de fuerzas en sectores como Zenteno-Gondra y su participación en la defensa durante la Batalla de Toledo.

En la posguerra también ocupó funciones políticas y diplomáticas, desempeñándose como ministro de Guerra y Marina, embajador del Paraguay en los Estados Unidos e integrante de la delegación paraguaya en la Conferencia de San Francisco de 1945.

Además de su carrera militar y diplomática, dejó importantes estudios sobre la Guerra del Chaco, convirtiéndose en una referencia para el análisis histórico y estratégico de aquel conflicto.