El 10 de septiembre de 1957. Se crea el Servicio Nacional de Lucha contra la Fiebre Aftosa (Senalfa), después denominado Servicio Nacional de Calidad y Salud Animal (Senacsa).
El 10 de septiembre de 1967 fue creado en Paraguay el Servicio Nacional de Lucha contra la Fiebre Aftosa (SENALFA), mediante la Ley N.º 1267.
La institución surgió ante la necesidad de establecer un organismo especializado en la prevención, control y erradicación de la fiebre aftosa, enfermedad que afectaba especialmente a la producción ganadera nacional.
Con el tiempo, sus funciones fueron ampliándose para abarcar otros aspectos relacionados con la sanidad animal y la protección de la salud pública vinculada a la actividad pecuaria.
En 1977 su estructura fue reorganizada y pasó a denominarse Servicio Nacional de Salud Animal, SENACSA.
Posteriormente, mediante la Ley N.º 2426 de 2004, adoptó la denominación de Servicio Nacional de Calidad y Salud Animal, consolidándose como organismo rector de la sanidad y calidad animal en el Paraguay.
