El 6 de octubre de 2015. Al posponerse la intervención de la Universidad Nacional de Asunción, Aníbal Filártiga renuncia al cargo de interventor.

El 6 de octubre de 2015 renunció el doctor Aníbal Filártiga a su designación como interventor de la Universidad Nacional de Asunción, en medio de la profunda crisis institucional que atravesaba la casa de estudios.

Filártiga cuestionó la decisión del Consejo Nacional de Educación Superior de otorgar a la UNA un plazo de diez días para presentar un plan de acción antes de avanzar con una intervención efectiva.

El médico consideraba que la magnitud de los problemas requería un proceso más amplio y sostenido, estimando que serían necesarios varios meses para encarar una reorganización seria de la institución.

Su renuncia se produjo en un contexto marcado por las movilizaciones estudiantiles de «UNA no te calles», que reclamaban transparencia, reformas internas y el fin de prácticas consideradas irregulares.

Filártiga había sido designado apenas unos días antes, por lo que su salida evidenció las fuertes tensiones existentes entre las autoridades educativas y los sectores que exigían una transformación profunda de la Universidad Nacional de Asunción.