El 29 de mayo de 2001. Nicanor Duarte Frutos asume la presidencia de la Asociación Nacional Republicana.

El 29 de mayo de 2001, Nicanor Duarte Frutos asumió formalmente la presidencia de la Junta de Gobierno de la Asociación Nacional Republicana (ANR) – Partido Colorado.
Su llegada a la conducción partidaria se produjo tras imponerse en las elecciones internas frente a sectores opositores dentro del coloradismo, consolidando su liderazgo político nacional.
Duarte Frutos encabezaba el movimiento Reconciliación Colorada, corriente vinculada originalmente al liderazgo del asesinado vicepresidente Luis María Argaña.
Asumió la presidencia de la ANR en un momento de fuerte crisis política e institucional, posterior al Marzo Paraguayo de 1999, y buscó reorganizar y reunificar las bases del Partido Colorado.
Este liderazgo partidario fue decisivo para proyectar su candidatura presidencial, que culminó con su elección como Presidente de la República del Paraguay para el período 2003-2008.
Años después, ya como presidente de la República, volvió a ser electo titular de la ANR en 2006, hecho que generó una fuerte polémica constitucional por la incompatibilidad entre la función presidencial y la conducción partidaria.